上海交大尹若贺研究组发现番茄响应紫外光UV-B新机制
番茄是一种重要的园艺作物,也是研究光形态建成的一种模式植物。目前设施栽培是我国番茄栽培的主要形式。设施栽培中光照对壮苗和番茄品质等具有重要影响。紫外光UV-B(280~315 nm)是太阳光中的一个有机组成部分。低剂量的UV-B作为一种环境信号被植物光受体UVR8蛋白感知,通过光信号转导,调控植物的生长发育、次生代谢和对环境逆境的适应性(Yin and Ulm, 2017; Liang et al., 2019; Podolec et al., 2021)。而强UV-B能够破坏植物细胞内的蛋白质和DNA等生物大分子,引起逆境胁迫反应(Shi and Liu, 2021)。光受体UVR8的突变体在模拟自然环境条件下的生长发育表现较野生型差,表明了UVR8介导的光信号通路对与植物适应环境具有重要的作用 (Favory et al., 2009)。研究发现光受体UVR8通过调控大量基因转录表达变化行使其生理学功能(Qian et al., 2020)。在UVR8信号通路上目前已经发现多个转录因子参与基因表达调控,其中转录因子HY5具有非常重要的作用(Brown et al., 2005)。然而紫外光如何激活HY5基因转录以及HY5转录动态变化的调控机理都不十分清楚。
2022年2月21日,上海交通大学农业与生物学院尹若贺课题组在The Plant Cell杂志发表了题为“Activation and negative feedback regulation of SlHY5 transcription by the SlBBX20/21–SlHY5 transcription factor module in UV-B signaling”的研究论文,揭示了在紫外光UV-B的处理下,番茄转录因子模块BBX20/21-HY5激活HY5基因转录,而过量积累的HY5蛋白抑制自身基因转录,形成自身负反馈环,维持体内HY5的水平,调节番茄的光形态建成(Yang et al., 2022)。
转录因子模块BBX20/21-HY5激活并反馈抑制HY5基因转录的模式图
前人研究发现HY5蛋白是光信号激活HY5基因表达所必不可少的一个元件(Binkert et al., 2014)。然而HY5蛋白缺少转录激活结构域,尚需要未知的辅助蛋白协同转录激活靶基因。在该研究中,研究人员发现在番茄bbx20 bbx21双突变以及hy5单突变体内紫外光激活HY5基因表达的能力显着下降。通过遗传和生化实验证明转录因子BBX20/BBX21和HY5相互作用,以相互依赖的方式激活HY5基因转录。然而在过表达BBX20或BBX21的番茄材料中,紫外光激活HY5基因表达能力反而较野生型明显下降,暗示存在一个负反馈调控机制。通过一系列蛋白-DNA结合实验,发现转录因子BBX20/21和HY5都结合在HY5基因启动子的同一个顺式作用元件上。在体外,HY5比BBX20蛋白具有更强结合HY5基因启动子的能力,在番茄体内紫外光处理引起HY5在自身基因启动子上进一步富集,并抑制BBX20蛋白与HY5启动子的结合。最后,在野生型AC(Ailsa Craig)番茄背景下过表达外源HY5能够显着抑制内源HY5的转录水平。通过这些主要实验证实了转录因子模块BBX20/21–HY5转录激活HY5,而过量积累的HY5蛋白通过和其协同作用蛋白BBX20/21竞争结合自身基因启动子,抑制HY5基因转录,形成一个自身负反馈调控环,从而维持适当的HY5表达水平(上图)。对野生型番茄进行不同时间长度的紫外光处理,发现HY5的转录水平确实是被紫外光瞬时激活,然后快速降低,表明HY5的自身负反馈调控具有重要的生理学意义。
实验室在前期研究中发现光受体UVR8能够在紫外光的处理下激活RUP基因(拟南芥RUP1/2的同源基因)的转录表达,而RUP通过调控光受体UVR8的二体/单体构象变化,抑制光受体的功能,形成另外一个负反馈调控环(Zhang et al., 2021)。在本研究中,利用番茄rup突变体,研究人员发现RUP负调控环只在早期抑制HY5的转录表达,而后期的负调控主要由HY5蛋白自身调节。因此,在光受体UVR8信号通路上存在至少两个不同的负反馈环,分别在光信号转导的早期和晚期发挥作用,平衡植物对紫外光UV-B的响应(上图)。
综上,该研究以园艺作物番茄为材料系统深入地解析了紫外光瞬时诱导HY5转录的调控机制,进一步拓展了UV-B转录调控网络,为设施园艺植物响应光环境信号提供了新的理论支撑。上海交通大学博士后杨国骞为论文第一作者,尹若贺副教授为论文通讯作者。实验室助理研究员林丽博士、张春丽博士,博士后方芳,已毕业硕士研究生董华茜、刘小瑞等都做出了重要贡献。该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、上海交通大学致远学者等项目资助。
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